PubMed Review

根据自然语言检索需求扩展 PubMed 检索式，抓取文献并调用大模型生成 brief/full 综述，支持飞书通知、任务队列和基于 PMID 的追问回答；依赖 MiniMax API、PubMed E-utilities 与 Python 脚本。

crayfish-ai

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最近更新 2026-07-24 06:20:00

分类：搜索依赖：代码执行 / 读写文件 / 第三方 API / 内部调用大模型应用场景：研究 / 摘要总结 / 报告撰写

安装技能

复制下面的话术发给你的 Agent，它会通过 secure-skills 检索并安装该技能。

执行命令安装此 skill： npx secure-skills-cli add pubmed-review

Metadata

name: pubmed-review
description: 飞书自然语言触发的 PubMed 文献检索与 AI 综述生成系统。支持专业检索式扩展、限定词过滤、AI 结构化综述（brief+full）、飞书通知、追问回答。

PubMed Review Skill

Skill 说明

当用户在飞书发送 PubMed 相关检索需求时，本 skill 自动完成：

意图识别（pubmed_review vs other）
检索词提取 + 标准化 + OR/AND 扩展
PubMed E-utilities 文献检索
AI 综述生成（brief + full）
飞书推送 brief
本地存储 full 综述
追问回答（基于 PMID 上下文）

所需环境变量

变量名	必须	说明
`MINIMAX_API_KEY`	✅	MiniMax API Key
`MINIMAX_API_URL`	否	默认为 `https://api.minimax.chat/v1/text/chatcompletion_v2`
`MINIMAX_MODEL`	否	默认为 `MiniMax-M2.7-highspeed`
`NOTIFY_PATH`	否	飞书 notify 脚本路径，默认为 `which notify`
`MINIMAX_ENV_FILE`	否	环境变量文件路径，默认为 `./.env.minimax`

调用方式

通过 OpenClaw 飞书（推荐）

用户在飞书向 OpenClaw 发送自然语言消息，系统自动触发 pubmed_intent_handler.py。

直接命令行

# 创建任务
python3 scripts/add_pubmed_task.py "瘢痕激光" [max_articles]

# 触发检索（通过调度器）
python3 scripts/task_dispatcher.py

# 直接运行检索
python3 scripts/run_pubmed_review.py <task_id>

# 生成综述
bash scripts/run_pubmed_summary.sh <articles_json> <task_id>

# 追问回答
python3 scripts/pubmed_followup_handler.py "<用户追问>"

任务队列

任务存储在 tasks/ablesci_tasks.json（pubmed_review 类型任务也在此队列）。

字段规范：

{
  "id": "pubmed_<timestamp>_<random>",
  "type": "pubmed_review",
  "status": "pending|running|completed|failed",
  "created_at": "2026-04-10 12:00:00",
  "payload": {
    "topic": "瘢痕激光",
    "max_articles": 10,
    "search_term": "(scar OR keloid...) AND (laser...) AND last 5 years[dp] AND review[pt]"
  }
}

输出结构

飞书通知（brief）

📋 PubMed 文献综述完成

主题：acne isotretinoin
摘要提取：10 篇
综述文件：./results/pubmed/pubmed_xxx_summary.md

[brief 正文，约200字，多行显示]

本地文件（full）

路径：results/pubmed/{task_id}_summary.md

格式：Markdown，含完整综述正文 + 参考文献列表

追问回复

📖 综述追问回复

[LLM 回答内容，含 PMID 和文献标题]

检索式扩展规则

OR 扩展（同义词组）

主题词	扩展
`scar`	`(scar OR keloid OR hypertrophic scar)`
`laser`	`(laser OR fractional laser OR pulsed dye laser OR PDL OR CO2 laser)`
`infantile hemangioma`	`(infantile hemangioma OR hemangioma)`

限定词叠加优先级

时间：最近5年 > 最近10年（互斥，取最高优先级）
文献类型：系统评价 > meta分析 > 综述（互斥）
人群：儿童 + 成人同时出现时跳过（不添加过滤）
研究类型：随机对照 > 临床研究（仅在无其他过滤时使用）

追问上下文绑定

优先级（4层 fallback）：

消息中显式包含 task_id: pubmed_xxx → 精确绑定
当前有活跃追踪的综述任务 → 复用
从关键词匹配最近完成的任务 → 模糊匹配
无任何匹配时追加提示，要求用户提供 task_id

错误处理

错误类型	处理方式
MiniMax API 失败	降级为结构化摘要（来自 articles.json 摘要字段）
PubMed 检索失败	任务标记为 failed，飞书通知
Cookie 失效	暂停监控，飞书告警
LLM JSON 解析失败	自动规范化换行符后重试

发布信息

版本：v2.2.7-beta
依赖：Python 3.8+, PubMed E-utilities（免费）, MiniMax API
许可证：MIT